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副标题要不要直接在NCBI的GEO数据库查看表达谱数据
NCBI的GEO数据库是芯片数据的海洋，很多同学会在这里面找一些数据自己分析一下，为后续研究做些准备。这“很多同学”中的大多数需求都只是简单的想要找找不同样本/分组之间的差异，其实网站本身就提供了这样的功能，不需要把原始数据下载下来用某些专业的软件进行分析。小编今天以截图+说明的方式为大家简单介绍一下如何在GEO数据中找差异。（多图预警）
? 1. 首先进入NCBI主页：
2. 选择GEO Datesets：
3. 输入想要搜索的内容（此处以某文献中提供的GEO号为例，也可以搜某疾病、某组织、某物种等）：
4. 点击Search后得到如下页面：
这里请注意：
这篇文献搜到的结果没有自带简单分析，如果是自带简单分析结果的，搜索出来的界面是这样的（此处直接搜的物种名）：
可以看到，每个条目都是有图的，点击图片可以看到如下页面：
利用该页面可以选择用来比较的不同样本，查看差异表达谱。
下面介绍没有该结果应如何做简单差异分析。
5. 结合文献，可以看出第一个结果就是我们要找的，点开链接得到如下页面：
这个按钮，得到如下页面：
7. 点击Define groups并定义分组（此处以定义处理和对照为例）
8. 点选样本然后再点选分组，即可将样本加入该分组：
9. 将需要进行分析的所有样本加入分组后，就可以使用页面下方的分析：
10. 比如，不修改设置（即使用默认设置），点击Top 250，得到如下页面：
可以看到，上图结果是按照P值由小到大、自上而下排列的，给出了前250个结果。这就是默认设置下，差异最显著的前250个结果。
11. 根据给出的结果，您可以挑选感兴趣的差异转录本进行验证或设计下一步实验。
责任编辑：
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公司立足于高通量测序、基因芯片和文库构建三大技术体系，拥有12年建库经验，协助
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(第二讲上)基因芯片公共数据获取与利用
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【作者单位】：
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