做pcr时异丙醇胺和 氯仿加反了会不会有影响

仍然是关于核酸提取(核酸提取,氯仿,分层,异丙醇) - PCR实验 - 生物秀
标题: 仍然是关于核酸提取(核酸提取,氯仿,分层,异丙醇)
摘要: [仍然是关于核酸提取(核酸提取,氯仿,分层,异丙醇)] 小弟做实验郁闷得不行了,10 1国庆还得在实验室过作了几次RNA提取,在加了氯仿和异丙醇后就是不出现3个分层,我也不知道问题出在哪儿,希望牛人指教啊!help me!!!谢谢! 关键词:[核酸提取 氯仿 异丙醇 分层]……
小弟做实验郁闷得不行了,10.1国庆还得在实验室过作了几次RNA提取,在加了氯仿和异丙醇后就是不出现3个分层,我也不知道问题出在哪儿,希望牛人指教啊!help me!!!谢谢!
回复请看下面的实验步骤!在加入氯仿后会出现分成!请注意实验步骤有没有错误,你用的是不是都好用!(1)细胞用PBS冲洗两遍,根据细胞多少加TRIzol 2-3ml 室温静置5min(2)吹打细胞,每1ml分一个Eppendnrf管(3)每管加0.2mL氯仿,剧烈震荡15S,室温静置2-3min(4)4℃ 12000g 离心15min(5)吸取上清约300ul,加入0.5ml异丙醇,翻转混匀,室温静置10min(6)4℃ 12000g 离心10min(7)弃上清,加75%乙醇1ml(750无水乙醇,250DEPC处理的水),弹指法混匀。(8)4℃ 7500g离心5min(9)弃上清,干燥5-10min(10)溶于10-20ul DEPC水中(如有多个Eppendorf管,将其余的管冻在-70℃保存),进行下一步的检测。回复请参照yihui88117 的步骤,注意加异丙醇后,室温静置10min回复请参照yihui88117 的步骤,注意加异丙醇后,室温静置10min回复我也是一样,不过我做的是提取,我唯有再离心10分钟,最后可以离心出来了,不过仍在疑惑中,到底这样做正不正确?还望各路高手赐教!回复不明白楼主说的出现三个分层是哪三个分层呢?我提RNA时每次都只有一个分层:加入氯仿时与trizol有分层,离心后倒是有分层,上层为透明水相,中间有一层白色物为蛋白质,其下为有机相(不知楼主指的是否是这个分层?)。取上清,再加异丙醇这时可以出现沉淀物,也没有你说的分层现象。楼上的素蔓看不明白你的问题是什么,所以不知如何解答。是不是说异丙醇沉淀时肉眼没有可视沉淀物,离心之后才有?当然可能了,因为如果你提取血样里的,取样量少,淋巴细胞相对就少,而抽得的DNA量会更少,即使有沉淀也都是些丝状物,如果你的眼神不好的话是不大能看得到的。如果你用5ml血抽提的话,哈哈,感觉就会大不一样了。不过有病人让你这么奢侈的做吗?回复忘了告你,我用小鼠的血约600ul,沉淀时可以见几个象灰尘一样的毛毛儿。
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【求助】抽RNA用的氯仿、异丙醇、乙醇放久了能否继续用,谢谢!
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这个帖子发布于9年零152天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
氯仿、异丙醇、乙醇是师姐以前抽RNA时剩下的,放在室温保存已有1年了。本人抽RNA的时候采用的是Trizol抽提,氯仿、异丙醇、乙醇就用师姐剩下的这些试剂进行抽提。然而,抽提效果很不理想。加入异丙醇离心之后,EP管管底只看到无色的胶状沉淀,根本就看不到所谓的白色沉淀,A260/A280比值在1.3~1.4左右。甚至有的少于1.0。不知道这些试剂放置久了,是否会污染上RNA酶导致RNA降解?希望高手指点一二,不胜感激。
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这些试剂都不贵,还是换了吧,有时候过分节约就是浪费。
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丁香园中级站友
可以考虑这方面的原因,不过我相信不是问题的关键,因为我们实验室的试剂放置超过2年效果仍然很好,但是不排除气温等影响.我想问题的关键还是起始量以及操作的问题,组织或是细胞都加大起始提取的量,在最后沉淀的一步加入3MPH3.8的NAAC可以增加回收效率,最后沉淀放置的时间久一些也可以增加回收效率
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谢谢两位!但似乎用Trizol抽提并没有用到NAAC。步骤大致是这样的:1、加trizol匀浆化2、加氯仿离心之后分成三相3、吸取上层水相到一新的EP中4、加入异丙醇沉淀RNA5、去上清,75%乙醇洗沉淀6、离心,去上清,干燥RNA7、加20~40ulDEPC的水溶解RNA。我抽RNA是要反转录,最后进行PCR的。不知道版主说的是不是把步骤7改为NAAC溶解?另外我对RNA进行了一个琼脂糖电泳【普通的那一种,不是甲醛变性电泳】,可以看到三个明亮的条带,其中18S、28S条带亮度一样。除此之外,在18S、28S之间、5S、18S之间可以看到许多其它条带。不知道说明什么问题?谢谢!
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依医 edited on
用别人剩下的试剂做自己的试验尤其对于新手来说是大忌!
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whitebear 这些试剂都不贵,还是换了吧,有时候过分节约就是浪费。就是这样了
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上述试剂可以用,楼主提取RNA时‘根本就看不到所谓的白色沉淀’除了遵循常规操作外,关键之处要特别注意:一定要用新鲜配置的75%乙醇DEPC水。
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怀念湘水 上述试剂可以用,楼主提取RNA时‘根本就看不到所谓的白色沉淀’除了遵循常规操作外,关键之处要特别注意:一定要用新鲜配置的75%乙醇DEPC水。加入异丙醇之后还没有加75%乙醇前,就没有看到白色的沉淀了。75%乙醇我用的确实是新鲜配制的冰冷的75%乙醇DEPC水。
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关于丁香园大家提取RNA时候用的试剂怎么保护的最近在做RNA提取。买了一些试剂,据说最好自己分装开避免污染。我觉得氯仿、异丙醇之类是否用棕色的瓶子装比较好。实验室有那种玻璃塞子的棕色广口瓶瓶。。这种瓶子能不能200度高温处理。?那应该是不耐热的吧。。。那大家怎么处理的
提RNA的试剂最好是能够单独出来专门用来提RNA。最好不要混着用,反正这些试剂也不怎么贵啊。有的实验室提RNA的所有东西,包括移液器,都是专门的。
也就十几二十块钱的东西,有必要再分装再灭菌么,单独用一瓶就好了么玻璃仪器都能干热灭菌的,170度3h就可以。塑料的用depc处理,溶液都要用depc水配制
德元国际提取RNA,可以找找看
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扫描下载二维码在酚:氯仿:异戊醇中,异丙醇代替异戊醇有没有有同(异戊醇,氯仿,异丙醇) - PCR实验 - 生物秀
标题: 在酚:氯仿:异戊醇中,异丙醇代替异戊醇有没有有同(异戊醇,氯仿,异丙醇)
摘要: [在酚:氯仿:异戊醇中,异丙醇代替异戊醇有没有有同(异戊醇,氯仿,异丙醇)] 在酚:氯仿:异戊醇中,异丙醇代替异戊醇有没有有同?请赐教! 关键词:[异戊醇 氯仿 异丙醇]……
在酚:氯仿:异戊醇中,异丙醇代替异戊醇有没有有同?请赐教!
回复好像不可以的,在酚:氯仿:异戊醇中异戊醇的作用是去泡剂,避免产生过多的泡沫。异丙醇好像没听说过有这个作用,倒是它可以用来沉淀,70%时洗涤。回复在酚:氯仿:异戊醇中,异戊醇的主要作用是辅助消除氯仿使用蛋白质变性时产生的泡沫,有利于分离。而异丙醇虽也是一种有机溶剂,但其能沉淀DNA,且不利于水和有机相的分离。故在这一比例中(25:24:1)中,不能用异丙醇代替异戊醇。回复谢谢二位的热心解答!我发现有的书上用酚:氯仿:异戊醇而的书上用酚:氯仿:异丙醇,因此我不知道是笔误还是怎么回事。回复呵呵!肯定是笔误了!这样编书真是误人子弟呀!
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电话:021-(请问)哪位高人能指点提取总RNA中各试剂的具体作用?(试剂,氯仿,异丙醇) - PCR实验 - 生物秀
标题: (请问)哪位高人能指点提取总RNA中各试剂的具体作用?(试剂,氯仿,异丙醇)
摘要: [(请问)哪位高人能指点提取总RNA中各试剂的具体作用?(试剂,氯仿,异丙醇)] 我想了解一下TRIZOL试剂提取总RNA的方法中,各试剂:TRIZOL,氯仿 异丙醇及75%乙醇的作用 请各位指教! 关键词:[试剂 氯仿 异丙醇]……
我想了解一下TRIZOL提取总RNA的方法中,各:TRIZOL,氯仿.异丙醇及75%乙醇的作用.请各位指教!
回复在网上用google查询一下其说明书就可以了回复我也是初学RNA提取,据我所知:1.TRIZOL既有裂解液(硫酸氰胍)的成分,又有变性液(酚、氯仿、异丙醇)的成分,硫酸氰胍有破坏细胞结构,使核酸从中解离的作用,并且对RNA酶有强烈的变性作用,是一种最有效的RNA酶抑制剂。酚和氯仿也可以使蛋白质和核酸分离,并且作为蛋白质变性液可以抑制RNA酶活性。2.加入氯仿后分三层,是通过氯仿使蛋白质变性,疏水的氨基酸在有机层,亲水的氨基酸通过离心在中间的白层,核酸亲水在上面的水层。3.加入异丙醇是沉淀RNA,加入75%乙醇是洗涤沉淀,具体我也不清楚,望各位指教!回复三楼的介绍很详细啊,感觉又有新的收获!建议加分回复谢谢anranar的帮忙!回复1.TRIZOL既有裂解液(硫酸氰胍)的成分,又有变性液(酚、氯仿、异丙醇)的成分,硫酸氰胍有破坏细胞结构,使核酸从中解离的作用,并且对RNA酶有强烈的变性作用,是一种最有效的RNA酶抑制剂。酚和氯仿也可以使蛋白质和核酸分离,并且作为蛋白质变性液可以抑制RNA酶活性。2.加入氯仿后分三层,是通过氯仿使蛋白质变性,疏水的在有机层,亲水的通过离心在中间的白层,核酸亲水在上面的水层。
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