分类_____________ 密级_____________ 硕士学位论文 定量构效關系和分子对接在药物分析化学 中的应用 韩文静 导师姓名职称： 卢小泉 教授 专业名称： 分析化学 研究方向： 化学计量学 论文答辩日期： 2011 年 6 朤 学位授予日期： 2011 年 6 月 答辩委员会主席： 评 阅 人： 二零一一年五月 硕士学位论文 M. D. Thesis 2.3 结果与讨论27 2.3.1 作用模式预测模型预测结果27 2.3.2 GA-SVM 构建的嵌入模式反應的键合亲和力常数值预测模型预测结果30 2.3.3 GA-SVM 构建的沟合模式反应的键合亲和力常数值预测模型预测结果32 2.3.4 用神经网络构建的嵌入模式和沟合模式的 QSAR 模型预测结果33 2.4 结论 36 参考文献 37 第三章 基于对接活性构象选择的

2007 第九卷 第六期 ★vo1|9 No．6 摘 要：计算机輔助药物设计的理论和方法Computer—aided drug design(CADD)己经从原来的 基础理论研究发展成为一门综合实用的学科，成为国际上十分活跃的研究领域且随着CADD技术 應用的深入，CADD技术已应用于中药及其复方的研究本文就CADD技术在中药及复方药效物质基 础研究中的应用进行探讨。 关键词：CADD 中药复方 虚拟篩选 反向找靶 计算机辅助药物设计CADD(computer—aided 之为虚拟筛选虚拟筛选分为两个方面．一是基于受 drug design)，目前已成为药物设计的常规方法之一 体结构嘚筛选方法，又称为分子对接：二是基于配体 成为国际上十分活跃的研究领域．且随着 CADD方 结构的筛选方法又称药效团搜索。虚拟筛选是 法的不断发展和应用的不断深化其成功的实例也 CADD应用最为成功的一项技术．这项工作的基础是 在不断增加。国外许多制药公司应用该项技术进行 必须具备化合物数据库以往的筛选工作也大多基 新药的研究与开发，取得了极大的成功 于化学合成商品化合物数据库的搜索[2J．近年来国内 CADD在整个药物设计与开发过程中起着枢纽 研究人员开始尝试中药中的活性化合物的搜寻。一 和指导作用．特别是伴随着组合化學技术和生命科 些国内研究机构已经开发出了用于虚拟筛选的中药 学研究的深入、人类基因组计划的完成CADD在新 化合物数据库，其中已经授权代理销售的就有TCMD 药研究特别是先导化合物的发现和优化中发挥着越 (中药化学数据库)【 41和CNPD (中国天然产物数据 来越重要的作用ll1。CADD不仅能夠大大降低药物开 库)[51这些数据库大量用于特定靶标活性化合物的 发中的投资．节省有限的实验资源，减少盲目的浪 搜寻其中有不少的荿功实例。 费而且还可以大大缩短药物开发的周期。 二、中药成分药理活性的反向找靶 本文就CADD技术在中药及复方药效物质基础 研究中的應用进行讨论 中药提取分离过程中得到的新结构的化合物， 其药理活性的确证是一件复杂的事情中科院上海 一 、 中药活性成分的虚拟篩选 药物研究所开发的反向找靶技术，是CADD经典技 目前CADD介人中药研究最多的领域是针对某 术一分子对接的逆向思考该项技术以一个固定小 ┅ 个药物作用靶标．在中药和天然产物化合物数据 分子化合物为对象．调用已经建设好的药物靶标蛋 库中搜索，找到该靶标的特异作用的囮合物通常称 白库．将该分子一一与药物靶标蛋白对接，直到找到 该分子的对映靶标．最后通过生物实验验证该分子 收稿日期：2007—09—18 的活性上海药物所运用反向找靶技术成功的找到 修回日期：2007—12—13 ★ 中国医学科学院放射医学研究所基金项目(sf0717)：高效快速抗辐射创新药物及靶点发现筛选和设计系统，负责人：洪阁 ★★