怎么用用discovery si6tudio模建蛋白三维结构


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  这个是工具啦我一般用discovery si6tudio3.0做,至于预测都是搞同源模建吧。直接预测的没一个准的真正专家没人信这个,只有晶体结构才是硬道理!

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【摘要】:目的构建人类CCR4受体的彡维结构并分析其活性位点方法采用同源模建方法构建人类CCR4受体的三维结构,采用Discover进行能量最小化。采用Profiles-3D残基兼容性检测软件、Modeller下的Dope打分鉯及NIH的SAVS方法对CCR4蛋白的三维结构的合理性和可信度进行评估采用进化痕迹和相关突变分析两种方法对模建蛋白进行活性位点分析。结果构建了人类CCR4受体的三维结构,并确定了CCR4受体的关键氨基酸主要分布在N-端和跨膜区TM3、TM6、TM7,胞内区为活化位点结论通过同源模建法构建的人类CCR4受体嘚三维结构合理、可靠。

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