生物分子下游纯化的对象一般包括蛋白、酶、重组蛋白、单抗、抗体及抗原、肽类、病毒、核酸等纯化前首先需要测定生物分子的各物理和化学特性，然后通过实验选擇出最有效的纯化流程

当目标蛋白的物理特性如分子量、PI等都不清楚时，可用PAGE电泳方法或层析方法加以测定分离范围广阔的Superose HR预装柱很適合测定未知蛋白的分子量。用少量离子交换介质在多个含不同PH缓冲液的试管中可简易地测出PI，并选择纯化用缓冲液的最佳

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